為造福中部癌症患者不用再南北奔波，在地就能獲得先進的質子放射治療服務，中國醫藥大學附設醫院於2019年開始建置中部首座「質子治療中心」，並於2024年7月正式啟用。 質子治療是先進的粒子射線療法，與傳統X射線光子療法相較，質子射線穿透正常組織時釋放的能量低，直到預定腫瘤部位深度（布拉格峰）才釋放最大能量，同時不會影響到後面的組織。因此能量精確集中在腫瘤上，避免損害周圍正常組織，達到降低副作用、增加控制率、提高生活品質的特點。質子治療適用於身體各部位，特別是位於敏感區域或靠近重要器官的腫瘤，包含腦瘤、頭頸部腫瘤、乳癌、肺癌、食道癌、肝癌、攝護腺癌、復發性腫瘤等。尤其對於不適用重粒子之兒童癌症病人，更可以降低長期後遺症。